1938年，“Rapid”进行了全面的改变，包括外形改进以及搭载一个带顶置式气门的发动机。新的发动机排量降低为1.6升，然而最大功率却达到了43马力（31kW）。值得一提的是，当年汽车史上诞生了一款经典车型，也就是大家非常熟悉的甲壳虫。甲壳虫搭载的是一款1.0升4缸发动机，最大功率为24马力（18kW），从账面数据来看，略逊色于“Rapid”。
正当斯柯达欲大展拳脚时，战争再次中断了它的发展。1939年，第二次世界大战爆发，捷克被德国入侵，汽车生产再次陷入停顿。1939年至1945年整个二战期间，斯柯达集团不得不转向军工生产，工厂的技术以及资源消耗可想而知。
战后的斯柯达成为了国有企业，并且名称换成了AZNP。处在计划经济体制下的斯柯达开始为百姓造车，目标是要造人民能买得起的车。1946年推出的Popular(在捷克称为Tudor)、1954年推出的明锐(Octavia)及后继的弗雷西亚(Felicia)成了斯柯达主要生产车型。当时偏向运动性能的“Rapid”在1947年被停产，随后被“遗忘”了37年，让人颇感遗憾。
